Em novembro de 1968, reuniram-se alguns membros da Comunidade Evangélica Arroio da Seca, a convite do Pastor Rolf Schiemann, com o objetivo de fundar um Jardim de Infância, como departamento da Comunidade Evangélica, para atender às crianças de dois anos e seis meses a seis anos, denominado de Jardim de Infância Arroio da Seca.
Na reunião de fundação foi eleita a diretoria para o ano de 1969, quando iniciaram as atividades do Jardim. O prédio utilizado era de propriedade da Comunidade Evangélica e situava-se na Avenida Dr. Ito João Snell, ao lado da Casa Pastoral.
Na ocasião foi fixada uma contribuição mínima mensal para as crianças matriculadas e contribuições para os demais membros fundadores, para que se pudesse, desta forma, custear as despesas de manutenção, material e pessoal.
Eram vinte e seis, os primeiros alunos matriculados para o ano de 1969, que seriam atendidos pela professora estagiária Marli Knepker Scheren.
Na década de 80, a Comunidade Evangélica Arroio da Seca continuou custeando parte da manutenção do Jardim, já o pagamento das professoras passou a ser assumido pela prefeitura de Estrela. Foi neste período também, devido à confecção de um guarda-pó para os alunos com a pintura de um arco-íris, que o educandário começou a ser chamado de Jardim de Infância Arco-Íris.
Com a instalação do Município de Imigrante, os custos do Jardim foram assumidos, praticamente na sua totalidade, pela Prefeitura, solicitando-se a participação dos pais na contribuição de materiais e serviços de limpeza.
A grande vitória que marcou os trinta anos de existência desta instituição foi a construção de sua Sede própria, inaugurada no dia 1º de maio de 1999, localizada na Rua Guilherme Ernesto Lagemann.
Em 05 de dezembro de 2001, através do Decreto Municipal nº 765/2001, houve a criação, denominação e alteração da denominação para Escola Municipal de Educação Infantil Arco-Íris. A então EMEI Arco-Íris tinha na época quarenta e dois alunos.
No ano de 2006, a EMEI Arco-Íris passou a atender as turmas de Jardim (turno da manhã), 1º ano e 1ª série (no turno da tarde).
Em 12 de julho de 2006, através do Decreto Municipal nº 1018/2006, foi criada a Escola Municipal de Ensino Fundamental Arco-Íris.
O espaço também se tornou pequeno. No dia 03 de março de 2008, realizou-se a mudança de prédio, situado na Rua Heinrich Brackemeier, 885.
Em 2013, a primeira turma de 8ª série concluiu o Ensino Fundamental, e em 2014, a primeira turma de 9º ano.
Até 2014, a Escola atendia somente à Educação Infantil Nível B (crianças com cinco anos completos até 31 de março). Em conformidade com o Plano Nacional de Educação, a partir de 2015, passou a atender também a Educação Infantil Nível A (crianças com quatro anos completos até 31 de março). Devido à falta de espaço físico, a Educação Infantil passou a ser atendida, na íntegra, num prédio anexo (primeiro prédio construído, na rua Guilherme Ernesto Lagemann), denominado carinhosamente de Escolinha. Esse espaço era utilizado pela EMEI Ciranda de Sonhos (denominada como Cirandinha), que atendia crianças de três e quatro anos completos até 31 de março. Devido à falta de espaço na EMEI Ciranda de Sonhos, a EMEF Arco-Íris passou a atender também aos alunos com três anos (completos até 31 de março). O Parecer n°019 do Conselho Municipal de Educação, de 10 de dezembro de 2015, autoriza o funcionamento de turma Educação Infantil – Creche de três anos na Escola Arco-Íris.
No entanto, essa estrutura física não era adequada para comportar o número elevado de alunos da Educação Infantil.
No dia 10 de fevereiro de 2018, foi inaugurada a extensão da EMEF Arco-Íris, na Rua Sete de Setembro, Bairro Esperança. Neste amplo espaço físico, em 2018, funcionou o turno integral para a Educação Infantil – Creche (crianças com três anos completos até 31 de março) e o contra turno dos alunos da Educação Infantil Nível A e B (crianças com quatro e cinco anos completos até 31 de março, respectivamente) e 1º a 4º ano, de manhã. À tarde, as turmas da Educação Infantil Nível A e B e 1º tinham aula nesta extensão. No entanto, ao longo do ano, percebeu-se que o espaço físico não era adequado para crianças em idade de Creche (três anos).
Em 2019, conforme Parecer nº 027 de 06 de novembro de 2018, a turma de Educação Infantil – Creche de três anos voltou a ser atendida pela Escola Municipal de Educação Infantil Ciranda de Sonhos.
Na Extensão da Escola Arco-Íris são atendidas, de manhã, as turmas de Turno Integral: Educação Infantil e Anos Iniciais (turmas do Jardim A ao 4º ano), à tarde, as turmas regulares da Educação Infantil, Jardim A e Jardim B. No prédio da Escola Arco-Íris são atendidos, de manhã, alunos do 5º ao 9º ano, e na parte da tarde, as turmas do 1º ao 4º ano. Em 2022, a Escola possui 219 (duzentos e dezenove) alunos matriculados.
Jardim de Infância Arroio da Seca/Arco-Íris – Professores:
1969 – Marli Knepker (estágio supervisionado pela professor Brigite)
1970 – Elite Schröer – auxiliada por Hildegard Klabunde e Luiza Kirchheim
1981 – Tânia Luiza Bernhard
1984 – Lira Landmeier Lutterbeck – auxiliada por Denise Ritter e Marisa Kaplan
1990 – Lira Landmeier Lutterbeck e Sandra Spellmeier (Divisão de turmas)
1991 a 1995 – Sandra Spellmeier e Susane Scheer Birkheuer
1996 – Dalia Rex Corotto, Susane Scheer Birkheuer e Esther Imhoff Wagner
1997 – Esther Imhoff Wagner e Dalia Rex Corotto
Obs.: A Professora Andréia Lohmann substituiu a professora Esther Wagner durante as duas licenças maternidade (setembro a dezembro de 1997 e maio a agosto de 1999).
1998 a 2000 – Esther Imhoff Wagner e Clair Teresinha Caio
Escola Municipal de Educação Infantil Arco-Íris – Professores:
2001 e 2002 – Analucia Teckemeier Vuaden e Dalia Rex Corotto
2003 – Marli Kucner Bücker e Dalia Rex Corotto
2004 – Marli Kucner Bücker e Esther Imhoff Wagner
2005 – Marli Kucner Bücker e Clair Teresinha Caio
Escola Municipal de Ensino Fundamental Arco-Íris – Direção
2006 a 2010 – Diretora: Clair Teresinha Caio
2011 e 2012 – Diretora: Susane Scheer Birkheuer
2013 a maio/2015 – Diretora: Juliane Prediger Zimmermann
Vice-diretora: Esther Imhoff Wagner
2015 – Diretora: Carla Klein Camilo
Vice-diretora: Esther Imhoff Wagner
2016 a 2020 – Diretora: Carla Klein Camilo
Vice-diretora: Sandra Spellmeier Zuchi
2021 a 2022 – Diretora Francielle Bücker
Vice-diretora: Tailita Luisa Tirp
2023 – atual – Diretora: Carla Klein Camilo
Vice diretora: Denise Maria Rabaioli Marsaca